五官科疾病的诊断及治疗，尤其擅长于耳内镜下中耳手术、微创化鼻内镜手术、个性化鼾症诊治、CO2激光喉显微手术、咽喉涎腺肿瘤手术。

司马国旗，男，主任医师，硕导，嘉兴医学院授课老师，浙江省医学会耳鼻喉科委员，浙江省抗癌协会耳鼻咽喉专业委员，嘉兴市医学会耳鼻咽喉学会委员，嘉兴市第五批、第六批后备学科带头人。北京同仁医院进修1年，多次到上海眼耳鼻喉科医院、上海市一、长海医院、上海六院、广州中山医院等国内耳鼻喉专科强势医院短期培训学习，对耳鼻咽喉头颈疾病有较全面和深入的临床诊治经验，能独立开展本专科手术，并积极追踪学科前沿与最新进展，不断技术引进与创新，始终把微创化、功能化、人文关怀的诊疗理念贯彻到日常临床工作中。在中华耳鼻咽喉头颈外科杂志(3篇)等发表论文20多篇。